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研究揭示蛋白质内稳态在抗真菌肽工程化中的意义

作者:andy       发布时间:2021-08-18       

Molecular Biology and Evolution在线发表了中国科学院动物研究所研究员朱顺义团队在抗真菌肽工程化改造领域的最新研究成果,研究论文题目为Evolution-Based Protein Engineering for Antifungal Peptide Improvement。该研究首次揭示蛋白质中一类氨基酸位点介导的内稳态可用于抗真菌肽的蛋白质工程改造。

近年来,由于抗真菌药物耐药性的发展,开发基于多肽支架的新型抗真菌药物已成为抗生素科学领域的新热点。传统的蛋白质工程技术,如定向分子进化、结构优化、计算机辅助的语言学模型(linguistic model)设计以及祖先序列重建等,虽然获得一定成功,但是由于多肽内在的序列、结构和功能以及作用靶点的复杂性限制了其广泛应用。

研究揭示蛋白质内稳态在抗真菌肽工程化中的意义

为此,该研究首次提出并应用抗真菌肽的进化记录(evolutionary record)信息实现对线虫来源的抗真菌肽柯莱姆素5号(Cremycin-5)(Zhu & Gao, 2014. Nature Communications)的人工改造。科研人员利用并系同源基因(paralog)的功能分化特性结合定点丙氨酸扫描技术,筛选出一个活性增强的氨基酸位点;利用定点饱和突变技术,获得一系列针对多个丝状真菌和单细胞病原酵母(白色念珠菌)活性增强的突变体。研究发现,除了酸性氨基酸的保守性替代之外,其它几乎所有非酸性氨基酸的替代均显着提升了野生型肽的抗真菌活性。系统评估代表性突变体E15K的抗真菌治疗潜能,证明其为新的抗真菌药物的先导物。基于此类位点突变效应的侧链化学不依赖性以及突变体广谱增强的抗菌活性,科研人员将其命名为“普遍可增强的活性调节位点”(Universally Enhanceable Activity-Modulating Site, UEAMS)。进一步研究发现,UEAMS的进化受到遗传背景相关的上位性(epistasis)调节,用以维持蛋白质内稳态的均衡。人工定点突变此类位点的氨基酸打断平衡可以显着改进人类所需的分子性状。


写到最后:

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